Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC93Q567U6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms