Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB6CQ53S08 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms