Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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