Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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RRN3P1Q2M238 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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RRN3P1Q2M238 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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RRN3P1Q2M238 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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RRN3P1Q2M238 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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RRN3P1Q2M238 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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