Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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CYTH1Q15438 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CYTH1Q15438 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CYTH1Q15438 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTH1Q15438 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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