Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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