Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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LSAMPQ13449 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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