Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ETFRF1-203ENST00000554266 429 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC090922.1-201ENST00000606244 1018 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ODF2L-213ENST00000478286 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RPL32P3-205ENST00000507287 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC073651.1-201ENST00000544015 465 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC007161.2-201ENST00000604734 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SUN3-202ENST00000395572 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms