Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1P60507 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms