Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTGS1P23219 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms