Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYBBP04839 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms