Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID3CA6NKF2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms