Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104772.1-201ENST00000444764 862 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL022318.1-201ENST00000450216 678 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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KRTAP9-9Q9BYP9 AC009078.1-201ENST00000474978 783 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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KRTAP9-9Q9BYP9 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02197-202ENST00000517705 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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KRTAP9-9Q9BYP9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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KRTAP9-9Q9BYP9 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP1B1-204ENST00000494864 1479 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SERPINB3-201ENST00000283752 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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