Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms