Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC16Q8NEE8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms