Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 886.5 ms