Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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