Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms