Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP2P81877 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms