Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPLNO95428 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPLNO95428 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms