Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3CA6NKF2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms