Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SRSF8Q9BRL6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms