Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms