Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPTE2Q6XPS3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms