Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms