Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms