Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RBM48Q5RL73 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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