Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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FXNQ16595 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FXNQ16595 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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