Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PRR4Q16378 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PRR4Q16378 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PRR4Q16378 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PRR4Q16378 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PRR4Q16378 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PRR4Q16378 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
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