Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms