Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms