Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL133216.1-201ENST00000428915 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 OR7E121P-201ENST00000494533 1022 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ACAT1-202ENST00000299355 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ARL14-201ENST00000320767 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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MKRN4PQ13434 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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MKRN4PQ13434 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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MKRN4PQ13434 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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