Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.843e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.883e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SERPINA3-206ENST00000555820 981 ntTSL 59.4□□□□□ -0.93e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-203ENST00000585949 2429 ntTSL 28.79□□□□□ -13e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SERPINA3-207ENST00000556388 480 ntTSL 47.3□□□□□ -1.243e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-209ENST00000591435 455 ntTSL 33.98□□□□□ -1.773e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.126e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.896e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.796e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-209ENST00000428279 1525 ntTSL 59.48□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.036e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-206ENST00000413623 1678 ntTSL 36.59□□□□□ -1.356e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.366e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.516e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 MARC1-203ENST00000443880 444 ntTSL 55.1□□□□□ -1.596e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL1R1-207ENST00000422532 574 ntTSL 53.36□□□□□ -1.876e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 MARC1-205ENST00000472269 346 ntTSL 33.29□□□□□ -1.886e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 27.34□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 HDLBP-232ENST00000470482 624 ntTSL 210.07□□□□□ -0.85e-6■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TBC1D20-203ENST00000461304 2024 ntTSL 1 (best)23.26■■□□□ 1.315e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.665e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TBC1D20-204ENST00000494633 3820 ntTSL 215.48■□□□□ 0.075e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TBC1D20-202ENST00000461188 5195 ntTSL 210□□□□□ -0.815e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.779e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.579e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.429e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NR2F6-202ENST00000596878 731 ntTSL 322.59■■□□□ 1.219e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFV1-222ENST00000532260 574 ntTSL 420.77■□□□□ 0.929e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.79e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.649e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 AC132008.2-202ENST00000414207 1286 ntTSL 518.98■□□□□ 0.631e-16■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SCRIB-207ENST00000531942 421 ntTSL 218.52■□□□□ 0.569e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.59e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.469e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-211ENST00000497928 711 ntTSL 517.64■□□□□ 0.419e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GAA-204ENST00000570803 956 ntTSL 517.37■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-205ENST00000455067 530 ntTSL 417.36■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.289e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 MGRN1-205ENST00000585676 629 ntTSL 416.64■□□□□ 0.259e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.259e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.239e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.119e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.099e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-203ENST00000444801 568 ntTSL 315.43■□□□□ 0.069e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSPH-209ENST00000427797 809 ntTSL 315.36■□□□□ 0.059e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 515.33■□□□□ 0.049e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-205ENST00000594001 1417 ntTSL 215□□□□□ -0.019e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-204ENST00000577292 1097 ntTSL 214.85□□□□□ -0.039e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 DHX38-205ENST00000564307 785 ntTSL 414.79□□□□□ -0.049e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 214.53□□□□□ -0.089e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ZNF445-203ENST00000460529 1312 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.139e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 IL32-208ENST00000525003 544 ntTSL 214.12□□□□□ -0.159e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-202ENST00000593761 891 ntTSL 514.09□□□□□ -0.159e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSPH-204ENST00000416592 739 ntTSL 513.92□□□□□ -0.189e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-219ENST00000601208 989 ntTSL 513.91□□□□□ -0.189e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-210ENST00000497674 563 ntTSL 213.91□□□□□ -0.189e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.279e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 213.32□□□□□ -0.289e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NUP210-203ENST00000479519 1312 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSPH-205ENST00000419984 744 ntTSL 313.2□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GAA-209ENST00000577106 812 ntTSL 313.19□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-217ENST00000597778 3898 ntTSL 213.17□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSPH-206ENST00000421312 633 ntTSL 513.16□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 LIMK2-205ENST00000425203 606 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.369e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-222ENST00000583737 525 ntTSL 412.76□□□□□ -0.379e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSPH-203ENST00000413218 539 ntTSL 412.2□□□□□ -0.469e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSPH-208ENST00000424596 555 ntTSL 411.93□□□□□ -0.59e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PSMD11-211ENST00000585265 670 ntTSL 211.87□□□□□ -0.519e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 DHX38-203ENST00000563650 1123 ntTSL 311.46□□□□□ -0.579e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 AC132008.2-201ENST00000453454 956 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-16■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 MGRN1-216ENST00000592256 590 ntTSL 511.25□□□□□ -0.619e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ULK1-202ENST00000537421 959 ntTSL 311.2□□□□□ -0.629e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 MGRN1-210ENST00000588111 561 ntTSL 311.16□□□□□ -0.629e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-209ENST00000493692 951 ntTSL 511.14□□□□□ -0.639e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ADSL-219ENST00000636433 1444 ntTSL 510.93□□□□□ -0.669e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-204ENST00000593905 548 ntTSL 310.81□□□□□ -0.689e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 VARS2-210ENST00000490699 719 ntTSL 310.38□□□□□ -0.759e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.819e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 59.54□□□□□ -0.889e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 59.41□□□□□ -0.99e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 TTL-203ENST00000476615 725 ntTSL 38.07□□□□□ -1.129e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 28.02□□□□□ -1.139e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 47.64□□□□□ -1.199e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 GORASP2-206ENST00000471559 812 ntTSL 47.4□□□□□ -1.229e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ZNF207-217ENST00000584696 743 ntTSL 27.06□□□□□ -1.289e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-206ENST00000594155 416 ntTSL 57.03□□□□□ -1.289e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 36.62□□□□□ -1.359e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ADSL-216ENST00000625194 1079 ntTSL 55.78□□□□□ -1.489e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ID2-204ENST00000472142 474 ntTSL 25.75□□□□□ -1.499e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.559e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 35.31□□□□□ -1.569e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 PPIL2-209ENST00000485930 149 ntTSL 34.75□□□□□ -1.659e-7■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.126e-19■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 WFS1-206ENST00000513395 570 ntTSL 215.65■□□□□ 0.16e-8■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 WFS1-203ENST00000506362 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.66□□□□□ -0.386e-8■□□□□ 10.7
SF3A3Q12874 ZNF655-219ENST00000467680 1979 ntTSL 218.98■□□□□ 0.634e-6■□□□□ 10.7
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