Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN11Q06124 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms