Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms