Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms