Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP7P55210 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP7P55210 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP7P55210 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP7P55210 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP7P55210 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP7P55210 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP7P55210 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP7P55210 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP7P55210 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP7P55210 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms