Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PSMB10P40306 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms