Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms