Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms