Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPREP23469 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPREP23469 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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