Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms