Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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