Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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COPS7AQ9UBW8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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