Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CYLDQ9NQC7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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