Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms