Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms