Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms