Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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