Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RASSF3Q86WH2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms